Во время подготовки библиотеки сводятся к минимуму ошибки при лигировании или рекомбинации ДНК, что улучшает качество секвенирования. Обновленный EF Kit 2.0 обеспечивает значительно уменьшенную долю химерных прочтений, по сравнению с EF Kit 1.0. Количество химерных последовательностей, снижено до уровня подготовки библиотек с механической фрагментацией.
Чем меньше химер, тем меньше ошибок секвенирования
Высокая воспроизводимость, проверенная при валидации тест-набора, гарантирует уверенность в результатах экспериментов. Перекрытие кривых электрофореграмм библиотек NGS, созданных с помощью этого набора, демонстрирует минимальное отклонение между повторами образцов
Высокая воспроизводимость от образца к образцу
С помощью EF Kit 2.0 размер фрагмента библиотеки ДНК можно настроить в соответствии с вашими конкретными потребностями, просто настроив время фрагментации. Здесь показаны четыре электрофореграммы библиотек NGS, созданные с использованием разного времени фрагментации.
Настройте размер фрагмента в соответствии с потребностями вашего эксперимента
Улучшенная амплификация для минимизации ошибок секвенирования
Ошибки при амплификации неизбежны, но они не обязательно должны становиться рутиной. В состав нового комплекта EF Kit 2.0 входит смесь Equinox Master Mix с высокоточным ферментом для горячего старта. По сравнению с EF Kit 1.0, возникает меньшее количество ошибочно введенных оснований ДНК. Это увеличивает точность амплификации и качество данных секвенирования
Библиотеки NGS собирали с помощью EF Kit 1.0, EF Kit 2.0 или Twist Library Preparation with Mechanical Fragmentation Kit. Для обогащения целевых фрагментов использовали панели Twist Core Exome и системы Twist. Секвенирование выполняли на платформе NextSeq 550 или NextSeq 2000. Планки погрешностей представляют собой стандартное отклонение между повторами.
Восемь библиотек NGS были созданы с помощью EF Kit 2.0 и Twist's Universal Adapter System. 50 нг высококачественной гДНК фрагментировали в течение 20 минут при 37 ° C. Для амплификации использовали шесть циклов ПЦР. Образцы были проанализированы с помощью Agilent DNA 7500, а результаты визуализированы в программе Expert 2100.
Библиотеки NGS были созданы с помощью EF Kit 2.0 и системы универсального адаптера Twist. 50 нг высококачественной гДНК фрагментировали разное время при 37 ° C. Для амплификации использовали шесть циклов ПЦР. Образцы были проанализированы с помощью анализа Agilent DNA 7500, а результаты наложены в программе Expert 2100.
Использовали мастер-миксы для амплификации из EF Kit 1.0 и EF Kit 2.0. Случаи неправильного включения оснований измеряли с помощью запатентованного анализа на основе NGS. Показанные значения представляют собой среднюю частоту ошибок для всех случаев неправильного включения.